動画を無劣化で回転させるコマンドは以下です。
rotate=90
は時計回りに90度
-c copy
は無劣化(音声も映像もそのまま、メタデータのみ編集)になります。
ffmpeg -i input.mp4 -c copy -metadata:s:v:0 rotate=90 out.mp4
以下のページでは、無劣化での動画カットも紹介しています。
https://www.uki213.com/memo/ffmpeg-cut-excess-parts-video-without-degradation/